中国地震局地震大地测量重点实验室是在中国地震局地震研究所大地测量实验室基础上组建起来的，实行依托中国地震局地震研究所且相对独立运作的运行管理体制，按照二级事业单位进行管理。实验室具有独立的管理体系，日常管理由实验室自行进行。
实验室学术委员会是实验室学术领导机构，主要任务是审议和指导实验室的建设规划及目标、任务和研究方向等，审议实验室的重大学术活动安排、年度工作计划与工作总结、审批开放研究课题等。
实验室管理委员会是实验室建设协调机构，其职责是制定实验室规划和建设方案，对实验室运行进行统筹管理，协调研究所相关部门等工作。
实验室的日常管理实行中国地震局地震研究所领导下的主任负责制，具体管理职责由实验室管理办公室负责执行。
在具体工作中，实验室认真贯彻落实《中国地震局重点实验室管理办法（试行）》、《中国地震局地震大地测量重点实验室管理办法》、《中国地震局地震研究所重点实验室建设目标与实施路线》、《中国地震局地震研究所重点实验室日常运行维护管理办法（试行）》、《中国地震局地震研究所实验室重点仪器设备日常维护维修管理办法（试行）》等规章制度要求，切实做好各项日常管理工作，确保重大事项决策公开透明、人员岗位职责明确、档案资料完整、仪器设备运行状态良好，并注重发挥学术委员会的咨询指导作用。
依托单位中国地震局地震研究所高度重视地震大地测量重点实验室的运行与发展，在乐橙官网的人才招聘与配备、职称晋升、基本科研业务费专项、修购项目、后勤服务等方面对实验室发展予以大力支持，保障了实验室的良性运行和可持续发展。目前，实验室拥有实验及办公用房3500平方米，其中科研楼1-2楼房间为公共实验室，3-6层为实验室和办公用房，布局规划合理规范。
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